Data Engineering, Data Science, Software Development, Bioinformatics, 8x AWS certified
Aktualisiert am 03.04.2024
Profil
Freiberufler / Selbstständiger
Remote-Arbeit
Verfügbar ab: 02.03.2024
Verfügbar zu: 100%
davon vor Ort: 90%
Python
Data Scientist
AWS
Bioinformatics
Machine Learning
Datenanalyse
Statistik
R
Omics
Dokumentation
Scrum
C
C++
Shell-Script
Linux
Agile Softwareentwicklung
AWS
Datenbanken
Deutsch
Muttersprache
Englisch
verhandlungssicher
Russisch

Einsatzorte

Einsatzorte

Bonn (+200km) Cochem (+75km) Soest (+50km)
möglich

Projekte

Projekte

9 Monate
2023-04 - 2023-12

Entwicklung, Benchmarking und Analyse von Datenverarbeitungspipelines

Data Scientist
Data Scientist

- Softwareentwicklung (R, Python)

- Analyse von Genomikdaten für große Studien

- Processierung und statistisches- und Performancebenchmarking von Analysepipelines in der Cloud

- Visualisierung, reporting

Merck KGaA
1 Jahr 1 Monat
2021-07 - 2022-07

Data Engineer/ Data Scientist at Merck KGaA

Data Engineer/ Data Scientist R Python Gitlab ...
Data Engineer/ Data Scientist

Evaluation and extension of Omics analysis pipelines. Data analysis, testing, software development, visualisation and reporting.

 

Genedata Profiler
R Python Gitlab Conda Linux Windows
Merck
Remote
1 Jahr 5 Monate
2020-02 - 2021-06

Data Scientist at Boehringer Ingelheim GmbH (BI-X)

Data Scientist Scrum Cancer Genomics Nanopore Sequencing ...
Data Scientist

Entwicklung einer neuartigen Hochdurchsatzpipeline für long- und short-read Sequenzierdaten in AWS.

Datenaufbereitung, Qualitätskontrolle, Entwicklung von Algorithmen.

Konzeptionierung, Umsetzung, Simulation, Testen, Datenanalysen und Benchmarking der Infrastruktur.

AWS EC2 AWS S3 AWS CloudFormation AWS Step Functions AWS Lambda Python R Jira Confluence Docker
Scrum Cancer Genomics Nanopore Sequencing Illumina Sequencing PacBio Sequencing High-performance Computing Machine Learning Statistikanalysen
BI-X (Boehringer Ingelheim GmbH)
Ingelheim, remote
10 Monate
2019-02 - 2019-11

Entwicklung von Analysepipelines für zytometrische Daten (Python)

Software-Entwickler, Data Scientist Scrum JIRA Confluence ...
Software-Entwickler, Data Scientist
 
Weiterentwicklung, Anpassung, sowie Neuentwicklung von automatischen Analysetools im Bereich Robotik und Laborautomation, überwiegend in Python. Konzeptionierung, Implementierung und Dokumentation neuer Anwendungsfälle, Datenauswertungen und deren Darstellung im Rahmen des Einsatzes von Laborgeräten.

Konzeption und Implementierung von Analyse-Algorithmen und Testen in einer simulierten Umgebung sowie an den Geräten im Labor. Präsentation der Ergebnisse vor den jeweiligen Stakeholdern. 
 
Scrum JIRA Confluence SVN Git Python Jenkins
Weltweit führender Anbieter von Laborgeräten
Bergisch Gladbach
7 Monate
2019-04 - 2019-10

Einführung eines Machine Learning Modells in einer Bank

Data Scientist Python Pandas Machine Learning ...
Data Scientist

Datenanalysen, Datenengineering, Auswertungen und Modellierung für eine der führenden Banken Deutschlands.

Implementierung eines neuen Machine Leaning Modells für eine Anwending im Privatkundengeschäft. Zusammenarbeit mit den externen sowie hauseigenen Analysten, Data Scientists und IT-Experten. Aufbereitung der Rohdaten, explorative Analysen, Visualisierungen und Strukturierung der Daten.

Python Pandas Machine Learning Statistik SQL scikit-learn Jupyter
Jahnes GmbH
Bonn
3 Jahre 2 Monate
2015-11 - 2018-12

Entwicklung einer neuartigen statistischen Methode

Projektleiter
Projektleiter

Entwicklung eines ultraschnellen Algorithmus (10.000x Effizienz) der eine neuartige statistische Analyse von Sequenzdaten ermöglicht, Implementierung in C/C++, Anwendung auf genomische Studien zur Untersuchung von Erbrankheiten.

Köln

Aus- und Weiterbildung

Aus- und Weiterbildung

3 Jahre 3 Monate
2015-10 - 2018-12

Wissenschaflicher Mitarbeiter, Postdoc

-, Cologne Center for Genomics (CCG), Universität zu Köln
-
Cologne Center for Genomics (CCG), Universität zu Köln

Projektleitung und Projektentwicklung, Data Science, Big Data, Entwicklung von ultraschnellen Algorithmen und statistischen Methoden, Computation. Interdisziplinäre Kommunikation, Visualisierung, Präsentation, wissenschaftliches Schreiben.

4 Jahre 6 Monate
2012-01 - 2016-06

Promotion

PhD in Epidemiologie, Universitätsklinikum Bonn
PhD in Epidemiologie
Universitätsklinikum Bonn

Assoziationsanalyse in Big Genomic Data, Einfluss von seltenen genomischen Varianten auf Vererbbarkeit von Krankheiten, Regressionsmodelle, Monte-Carlo Simulationen, Resampling-Methoden, Statistik, Algorithmen, Anwendungsentwicklung

5 Jahre 1 Monat
2010-10 - 2015-10

Wissenschaflicher Mitarbeiter: Bioinformatik, Biostatistik, Genomik

-, Deutsches Zentrum für neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), Bonn
-
Deutsches Zentrum für neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), Bonn

Analyse von großen genomischen und Transkriptomischen Assoziationsstudien, Anwendungs- und Systemprogrammierung, wissenschafltiches Schreiben.  Internationale Kollaborationen, überwiegend in der Alzheimer- und  Krebsforschung.

3 Jahre 8 Monate
2011-01 - 2014-08

Projektarbeit, Fortbildung

Gastwissenschaftler, Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin
Gastwissenschaftler
Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin

Auswertung einer großen Krebsstudie, Exomsequenzierung, Entwicklung einer Analysepipeline, know-how Transfer, davon 8 Monate vor Ort in Berlin

6 Jahre 7 Monate
2003-10 - 2010-04

Diplom Physik

Dipl. Phys., Leibniz Universität Hannover
Dipl. Phys.
Leibniz Universität Hannover

Theoretische statistische und mathematische Physik, skaleninvariante Systeme, Quantenfeldtheorie

9 Monate
2007-09 - 2008-05

Gaststudent: mathematics and mathematical Physics

-, Trinity College Dublin
-
Trinity College Dublin

Vertiefung der Mathematik und theoretischen Physik  (Differentialgleichungen, Simulation, Astrophysik)

Position

Position

AWS, Data Engineering, Data Science, Bioinformatics, Biostatistics, Software Development

Kompetenzen

Kompetenzen

Top-Skills

Python Data Scientist AWS Bioinformatics Machine Learning Datenanalyse Statistik R Omics Dokumentation Scrum C C++ Shell-Script Linux Agile Softwareentwicklung AWS Datenbanken

Schwerpunkte

Analytics
Bioinformatik
Biostatistik
Business Intelligence
Cancer Genomics
Data Engineering
Data Science
Genomik
Illumina Sequencing
Machine Learning
Nanopore Sequencing
NGS (Next Generation Sequencing)
PacBio Sequencing
Sequencing
Statistik
Statistikanalysen
Transcriptomik

Produkte / Standards / Erfahrungen / Methoden

AWS
Confluence
Docker
Git
Jenkins
JIRA
Scrum
SVN

Programmiersprachen

awk
bash
C/C++
Pandas
Perl
Python
R
scikit-learn
sed

Datenbanken

SQL

Berechnung / Simulation / Versuch / Validierung

AWS CloudFormation
AWS EC2
AWS Lambda
AWS S3
AWS Step Functions
High-performance Computing
Jupyter
pbs
slurm

Branchen

Branchen

Biotechnologie, Pharma, Life Science, Finanzen

Einsatzorte

Einsatzorte

Bonn (+200km) Cochem (+75km) Soest (+50km)
möglich

Projekte

Projekte

9 Monate
2023-04 - 2023-12

Entwicklung, Benchmarking und Analyse von Datenverarbeitungspipelines

Data Scientist
Data Scientist

- Softwareentwicklung (R, Python)

- Analyse von Genomikdaten für große Studien

- Processierung und statistisches- und Performancebenchmarking von Analysepipelines in der Cloud

- Visualisierung, reporting

Merck KGaA
1 Jahr 1 Monat
2021-07 - 2022-07

Data Engineer/ Data Scientist at Merck KGaA

Data Engineer/ Data Scientist R Python Gitlab ...
Data Engineer/ Data Scientist

Evaluation and extension of Omics analysis pipelines. Data analysis, testing, software development, visualisation and reporting.

 

Genedata Profiler
R Python Gitlab Conda Linux Windows
Merck
Remote
1 Jahr 5 Monate
2020-02 - 2021-06

Data Scientist at Boehringer Ingelheim GmbH (BI-X)

Data Scientist Scrum Cancer Genomics Nanopore Sequencing ...
Data Scientist

Entwicklung einer neuartigen Hochdurchsatzpipeline für long- und short-read Sequenzierdaten in AWS.

Datenaufbereitung, Qualitätskontrolle, Entwicklung von Algorithmen.

Konzeptionierung, Umsetzung, Simulation, Testen, Datenanalysen und Benchmarking der Infrastruktur.

AWS EC2 AWS S3 AWS CloudFormation AWS Step Functions AWS Lambda Python R Jira Confluence Docker
Scrum Cancer Genomics Nanopore Sequencing Illumina Sequencing PacBio Sequencing High-performance Computing Machine Learning Statistikanalysen
BI-X (Boehringer Ingelheim GmbH)
Ingelheim, remote
10 Monate
2019-02 - 2019-11

Entwicklung von Analysepipelines für zytometrische Daten (Python)

Software-Entwickler, Data Scientist Scrum JIRA Confluence ...
Software-Entwickler, Data Scientist
 
Weiterentwicklung, Anpassung, sowie Neuentwicklung von automatischen Analysetools im Bereich Robotik und Laborautomation, überwiegend in Python. Konzeptionierung, Implementierung und Dokumentation neuer Anwendungsfälle, Datenauswertungen und deren Darstellung im Rahmen des Einsatzes von Laborgeräten.

Konzeption und Implementierung von Analyse-Algorithmen und Testen in einer simulierten Umgebung sowie an den Geräten im Labor. Präsentation der Ergebnisse vor den jeweiligen Stakeholdern. 
 
Scrum JIRA Confluence SVN Git Python Jenkins
Weltweit führender Anbieter von Laborgeräten
Bergisch Gladbach
7 Monate
2019-04 - 2019-10

Einführung eines Machine Learning Modells in einer Bank

Data Scientist Python Pandas Machine Learning ...
Data Scientist

Datenanalysen, Datenengineering, Auswertungen und Modellierung für eine der führenden Banken Deutschlands.

Implementierung eines neuen Machine Leaning Modells für eine Anwending im Privatkundengeschäft. Zusammenarbeit mit den externen sowie hauseigenen Analysten, Data Scientists und IT-Experten. Aufbereitung der Rohdaten, explorative Analysen, Visualisierungen und Strukturierung der Daten.

Python Pandas Machine Learning Statistik SQL scikit-learn Jupyter
Jahnes GmbH
Bonn
3 Jahre 2 Monate
2015-11 - 2018-12

Entwicklung einer neuartigen statistischen Methode

Projektleiter
Projektleiter

Entwicklung eines ultraschnellen Algorithmus (10.000x Effizienz) der eine neuartige statistische Analyse von Sequenzdaten ermöglicht, Implementierung in C/C++, Anwendung auf genomische Studien zur Untersuchung von Erbrankheiten.

Köln

Aus- und Weiterbildung

Aus- und Weiterbildung

3 Jahre 3 Monate
2015-10 - 2018-12

Wissenschaflicher Mitarbeiter, Postdoc

-, Cologne Center for Genomics (CCG), Universität zu Köln
-
Cologne Center for Genomics (CCG), Universität zu Köln

Projektleitung und Projektentwicklung, Data Science, Big Data, Entwicklung von ultraschnellen Algorithmen und statistischen Methoden, Computation. Interdisziplinäre Kommunikation, Visualisierung, Präsentation, wissenschaftliches Schreiben.

4 Jahre 6 Monate
2012-01 - 2016-06

Promotion

PhD in Epidemiologie, Universitätsklinikum Bonn
PhD in Epidemiologie
Universitätsklinikum Bonn

Assoziationsanalyse in Big Genomic Data, Einfluss von seltenen genomischen Varianten auf Vererbbarkeit von Krankheiten, Regressionsmodelle, Monte-Carlo Simulationen, Resampling-Methoden, Statistik, Algorithmen, Anwendungsentwicklung

5 Jahre 1 Monat
2010-10 - 2015-10

Wissenschaflicher Mitarbeiter: Bioinformatik, Biostatistik, Genomik

-, Deutsches Zentrum für neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), Bonn
-
Deutsches Zentrum für neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), Bonn

Analyse von großen genomischen und Transkriptomischen Assoziationsstudien, Anwendungs- und Systemprogrammierung, wissenschafltiches Schreiben.  Internationale Kollaborationen, überwiegend in der Alzheimer- und  Krebsforschung.

3 Jahre 8 Monate
2011-01 - 2014-08

Projektarbeit, Fortbildung

Gastwissenschaftler, Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin
Gastwissenschaftler
Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin

Auswertung einer großen Krebsstudie, Exomsequenzierung, Entwicklung einer Analysepipeline, know-how Transfer, davon 8 Monate vor Ort in Berlin

6 Jahre 7 Monate
2003-10 - 2010-04

Diplom Physik

Dipl. Phys., Leibniz Universität Hannover
Dipl. Phys.
Leibniz Universität Hannover

Theoretische statistische und mathematische Physik, skaleninvariante Systeme, Quantenfeldtheorie

9 Monate
2007-09 - 2008-05

Gaststudent: mathematics and mathematical Physics

-, Trinity College Dublin
-
Trinity College Dublin

Vertiefung der Mathematik und theoretischen Physik  (Differentialgleichungen, Simulation, Astrophysik)

Position

Position

AWS, Data Engineering, Data Science, Bioinformatics, Biostatistics, Software Development

Kompetenzen

Kompetenzen

Top-Skills

Python Data Scientist AWS Bioinformatics Machine Learning Datenanalyse Statistik R Omics Dokumentation Scrum C C++ Shell-Script Linux Agile Softwareentwicklung AWS Datenbanken

Schwerpunkte

Analytics
Bioinformatik
Biostatistik
Business Intelligence
Cancer Genomics
Data Engineering
Data Science
Genomik
Illumina Sequencing
Machine Learning
Nanopore Sequencing
NGS (Next Generation Sequencing)
PacBio Sequencing
Sequencing
Statistik
Statistikanalysen
Transcriptomik

Produkte / Standards / Erfahrungen / Methoden

AWS
Confluence
Docker
Git
Jenkins
JIRA
Scrum
SVN

Programmiersprachen

awk
bash
C/C++
Pandas
Perl
Python
R
scikit-learn
sed

Datenbanken

SQL

Berechnung / Simulation / Versuch / Validierung

AWS CloudFormation
AWS EC2
AWS Lambda
AWS S3
AWS Step Functions
High-performance Computing
Jupyter
pbs
slurm

Branchen

Branchen

Biotechnologie, Pharma, Life Science, Finanzen

Vertrauen Sie auf GULP

Im Bereich Freelancing
Im Bereich Arbeitnehmerüberlassung / Personalvermittlung

Fragen?

Rufen Sie uns an +49 89 500316-300 oder schreiben Sie uns:

Das GULP Freelancer-Portal

Direktester geht's nicht! Ganz einfach Freelancer finden und direkt Kontakt aufnehmen.