Erfahrener Data Scientist mit fundierten Fachkenntnissen in der Softwareentwicklung und im Software-Engineering. Beherrscht eine Reihe von Programmier
Aktualisiert am 17.03.2026
Profil
Freiberufler / Selbstständiger
Remote-Arbeit
Verfügbar ab: 17.03.2026
Verfügbar zu: 100%
davon vor Ort: 100%
Python
Künstliche Intelligenz
Statistik
TypeScript
JavaScript
C#
Java
R
Shell-Script
PowerShell
SQL
Machine Learning
Neural Network
Versuchsplanung/Design of Experiment
Unix-Administration
Massenspektrometrie
Transcriptomics/Genomics/differentially expression
Deutsch
Muttersprache
Englisch
Verhandlungssicher
Französisch
sehr gut
Spanisch
sehr gut
Dänisch
Altagssprachenniveau (staatlicher PD3-Sprachtest)

Einsatzorte

Einsatzorte

München (+50km)
Deutschland
möglich

Projekte

Projekte

9 Monate
2025-03 - 2025-11

Durchführung biostatistischer Auswertungen

Consultant Bioinformatics / Lead Bionformatician
Consultant Bioinformatics / Lead Bionformatician
  • Durchführung biostatistischer Auswertungen in Python und R
  • Fokus auf multi-omics Datenauswertungen in den Genomen Human und Mouse
  • Defintion eines Qualitäts-Scoringsystems für verschiedene Datensätze (Genomics, Proteomics, Massenspektrometrie), um den Vergleich von Datensätzen, die in verschieden Laboratorien erstellt wurden, zu ermöglichen, Implementierung in Python
  • Auswertung von Metagomics-Daten (Human)
  • Entwicklung voll automatischer Auswertungpipelines in Python
  • Entwicklung von FastAPIs für verschiedene bioinformatischer Tools und KI-Workflows
Alchemy Bio (USA, remote)
8 Monate
2024-05 - 2024-12

Entwicklung einer Python-Applikation

MOLEQLAR Analytics GmbH, Deutschland
MOLEQLAR Analytics GmbH, Deutschland
  • Entwicklung einer Python-Applikation, um Probeninformationen mittels GET/POST APIs zu verbeiten, wobei JSON-Daten in eine extern gehostete SQL-Datenbank integriert wurden
  • Entwicklung eines statistischen Frameworks zur inkrementellen Verarbeitung von LC-MS (Flüssigkeitschromatographie ? Massenspektrometrie) unter Verwendung der DIA-(Data Independent Acquisition-)-Software DIA-NN. Automatisierung der gesamten Datenanalyse in Python
  • Verarbeitung von LC-MS-Datensätzen von Histonen mit der Software Skyline, Erkennung posttranslationaler Modifikationen (PTMs) sowie von differentiell exprimierten Histonen, beispielsweise mithilfe von Student-t-Tests und Wilcoxon-Rangsummentests in R
Senior Scientist Bioinformatics
2 Jahre 8 Monate
2021-08 - 2024-03

Entwicklung automatisierter LC-MS-(Flüssigkeitschromatographie-Massspectrometrie)-Pipelines

Senior Bioinformatician
Senior Bioinformatician
  • Aufbau und Leitung der bioinformatischen Guppe
  • Entwicklung automatisierter LC-MS-(Flüssigkeitschromatographie-Massspectrometrie)-Pipelines in Python und C#
  • Entwicklung von Algorithmen und automatisierten Arbeitsabläufen in Python für die Verarbeitung und Analyse von LC-MS-Daten
  • Vergleich verschiedener DIA-(Data Independent Acquisition)-Softwarelösungen und Entwicklung entsprechender Python-Programme, um mit den Softwärelösungen arbeiten zu können
  • Erstellung einer Django-Webanwendung mit einer PostgreSQL-Datenbankanbindung, um die Eingabe von LC-MS-Daten und die Suche nach solchen Einträgen den Experimentatoren zu ermöglichen
  • Etablierung von Versuchplanungen (Design of Expriments (DoEs)), Implementierung in Python
  • Entwicklung und Automatisierung von Pipelines zur Identifizierung von Peptid- und Protein-IDs mittels DDA (Data Dependent Acquisition)
  • Entwicklung und Implementierung von Algorithmen in Python, um die zugrunde liegenden biologischen und physikalischen Mechanismen der entsprechenden Massenspektrometrie-KITs zu entschlüsseln
  • Mitwirkung an zahlreichen Forschungsprojekten
  • Einrichtung und Wartung eines GitLab-Servers sowie Einführung von Git als Versionskontrollsystem
  • Betreuung einer Masterarbeit
PreOmics GmbH, Planegg, Deutschland
2 Jahre 11 Monate
2018-09 - 2021-07

Entwicklung und Implementierung eines Deep-Learning-Algorithmus

Senior Scientist Bioinformatics
Senior Scientist Bioinformatics
  • Gründung und Leitung des Bioinformatik-Expertenteams
  • Entwicklung und Implementierung eines Deep-Learning-Algorithmus (unter Verwendung der Bibliotheken Keras und TensorFlow) zur Vorhersage optimaler Stabilisierungsformulierungen für Arzneiwirkstoffe (z. B. Viren, Proteine, insbesondere Antikörper) in Flüssigkeiten und Gefriertrocknungen
  • Entwicklung einer SQL-Datenbank für Wirkstoffe und Arzneimittel mit einer Weboberfläche in C# (mit ASP.NET MVC als Framework und TypeScript als Frontend)
  • Entwicklung eines Algorithmus in Python zur Ableitung von Metamerkmalen (spezifischen relevanten Eigenschaften) von Proteinen aus den Analysedaten, die vom Vorhersagealgorithmus der stabilisierenden Formulierungen verwendet werden
  • Entwicklung und Erweiterung von Versuchsplänen (Design of Experiments [DoEs]), Implementierung in R
  • Mitwirkung an einem Förderantrag der Bayerischen Forschungsstiftung
  • Mitwirkung an der Planung eines Developability-Assessments-Projekts in Zusammenarbeit eines strategischen Partners der Leukocare AG
Leukocare AG, Planegg, Deutschland
9 Monate
2018-01 - 2018-09

Rückkehr von Dänemark mach Deutschland

  • Behördliche Formalitäten: Versicherungen in Dänemark kündigen und in Deutschland neue abschließen, dänischer Auslands TÜV, damit das Auto von Dänemark nach Deutschland asgeführt werden darf, Verkauf der Wohnung in Dänemark usw.
2 Jahre 3 Monate
2015-10 - 2017-12

Leitung und Mitwirkung an zahlreichen pharmazeutischen Projekten

Senior Bioinformatics Expert
Senior Bioinformatics Expert
  • Leitung und Mitwirkung an zahlreichen pharmazeutischen Projekten mit Schwerpunkt auf der Evaluierung von Biomarkern unter Einsatz von Microarrays, Next-Generation-Sequenzierungen, Signalweganalysen (WikiPathways und Reactome Pathway Database) sowie Analysen von Protein-Protein-Wechselwirkungen (Systembiologie). Entwicklung von Programmen in Python, Perl und R unter Verwendung von Bioconductor-Paketen und der Software Cytoscape
  • Auswertung von NGS-Datensätze (Next-Generation-Sequenzierungen) von Ion Torrent RNA-Seq (Human)
  • Entwicklung von Python-Programmen, um überlappende Protein-Protein-Netzwerke zusammenzuführen und Gene-Ontology-Informationen den Knoten dieser Netzwerke hinzuzufügen
  • Erstellung statistischer Modelle (linearer und nichtlinearer) zur Analyse von Metagenomics-Daten, Implementierung in R
Intomics A/S, Lyngby, Denmark
12 Jahre
2003-10 - 2015-09

Genomics- und Transcriptomics-Projekte

Wissenschaflicer Mitarbeiter in der Bioinformatik
Wissenschaflicer Mitarbeiter in der Bioinformatik
  • Mitwirkung an zahlreichen Genomics- und Transcriptomics-Projekten verschiedener Modellorganismen, darunter A. thaliana, P. reticulata (Guppy), D. melanogaster und C. elegans (Microarray- und Tiling-Array-Analysen, NGS-Analysen (Next-Generation-Sequenzierung))
  • Entwicklung von Programmen in Java, Perl, C++ und R in Verbindung mit Bioconductor-Paketen für statistische Analysen und zur Visualisierung analysierter Daten
  • Entwicklung und Implementierung einer Enterprise JavaBeans-Anwendung mit JavaServer Faces als Frame Framework und einer zugrunde liegenden MySQL-Datenbank-Anbindung, die es Forschern ermöglicht, Oligonukleotid- und Plasmidsequenzen samt deren Metainformationen einzugeben und nach diesen zu suche suchen (schließlich einer BLAST- Suche)
  • Implementierung einer PHP/Perl-Pipeline, um Rohdaten von Read-Sequenzen zu verarbeiten und diese automatisch zusammen mit den zugehörigen Metainformationen in ein lokal bereitgestelltes SRA (Short Read Archive) mit einer zugrunde liegenden MySQL-Datenbank einzutragen
  • Implementierung einer PHP-Pipeline mit der PHP-PEAR-Erweiterung, um EST-Sequenzen von P. reticulata (Guppy) in eine MySQL-Datenbank einzutragen und über eine Weboberfläche danach suchen zu können, bei Bedarf auch eine Blast-Suche
  • Mitwirkung an mehrern internationalen Veröffentlichungen
  • Halten von Vorlesungen in deutscher und englischer Sprache an der Eberhard Karls-Universität Tübingen (?Bioinformatik für Biologen?) und am Max-Planck-Institut (?PhD advanced course for next generation sequencing?)
  • Betreuung von Diplomarbeiten in der Bioinformatik und der Informatik
  • Betreuung mehrer Studentenprojekte und Studienarbeiten
Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie
1 Jahr 2 Monate
2002-08 - 2003-09

Phylogenien von Prokaryoten

Postdoc in der Bioinformatik / Gruppe Algorithmen in der Bioinformatik
Postdoc in der Bioinformatik / Gruppe Algorithmen in der Bioinformatik
  • Hauptsächlich auf dem Gebiet der Phylogenien von Prokaryoten gearbeitet, dazugehörige Programme in Java implementiert, was zu einem Vortrag der ECCB-Konferenz und einer Veröffentlichung in der Fachzeitschrift Bioinformatics führte
  • Betreuung einer Studienarbeit
Eberhard Karls-Universität / Wilhelm-Schickard-Institut, Tübingen, Deutschland
11 Monate
2001-09 - 2002-07

Entwicklung theoretischer Modelle

Gruppenleiter der Bioinformatik
Gruppenleiter der Bioinformatik

  • Aufbau und Leitung der Bioinformatik-Gruppe als Kompetenzzentrum
  • Entwicklung theoretischer Modelle zur Kinetik von oberflächengebundenen und diffusionsbegrenzten Bindungsvorgängen sowie deren Umsetzung in C++- und Java-Sourcode

LifeBits AG Tübingen, Deutschland
11 Monate
2000-10 - 2001-08

Entwicklung am Online ?Sheego Shop? in Enterprise JavaBeans

Java EJB Consultant im e-Commerce
Java EJB Consultant im e-Commerce
Intershop Communications GmbH, Stuttgart, Deutschland

Aus- und Weiterbildung

Aus- und Weiterbildung

1993 - 1997

Dr. rer. nat. (Doktorabeit in der Kurzzeitspektroskopie und Laser-Physik)

Benotung: ?cum laude?

Max-Born-Institut und Humboldt-Universität zu Berlin, Deutschland


1986 ? 1992

Diplomphysiker

Benotung: 2 (?gut?)

Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg, Germany

Kompetenzen

Kompetenzen

Top-Skills

Python Künstliche Intelligenz Statistik TypeScript JavaScript C# Java R Shell-Script PowerShell SQL Machine Learning Neural Network Versuchsplanung/Design of Experiment Unix-Administration Massenspektrometrie Transcriptomics/Genomics/differentially expression

Produkte / Standards / Erfahrungen / Methoden

Profil

Erfahrener Data Scientist mit fundierten Fachkenntnissen in der Softwareentwicklung und im Software-Engineering. Beherrscht eine Reihe von Programmiersprachen sowie Cloud Computing (zusammen mit Docker und Kubernetes) und künstliche Intelligenz-Workflows. War in verschiedenen Funktionen in Deutschland, Dänemark und den USA tätig, und dabei in erster Linie für die Bioinformatik verantwortlich. Ergebnisorientiert mit langjähriger Team- und Projektleitererfahrung. Ausgezeichnet durch klare Kommunikation, Unterstützung von Kollegen und Mitarbeitern sowie Soft Skills.


Besondere Fähigkeiten und Kenntnisse

IT-Kenntnisse

  • Versionskontrolle: Git (GitHub, GitLab, selbst gehostetes GitLab), SVN, CVS
  • Entwicklung-Tools: Eclipse, Visual Studio, Visual Studio Code, PyCharm, Posit/Rstudio


Cloud Computing & DevOps

Methoden & Platform: Scrum, Conda/Anaconda, Cloud Computing (AWS), Docker, Kubernetes


Maschinelles Lernen & Künstliche Intelligenz

  • Maschinelle Lernen: Deep Learning Algorithmen/Neuronale Netwerke, Random Forests, XGBoost, Entscheidungsbäume
  • KI Agenten
  • Statistische Modellierung
  • Versuchsplanung (Design of Experiments (DoEs))


Führung

  • Aufbau und Gruppenleiter der Bioinformatik bei der PreOmics GmbH, Martinsried, Deutschland 
  • Aufbau und Gruppenleiter des Bioinformatik-Expertenteams bei der Leukocare AG, Martinsried, Deutschland
  • Projekleiter für Kundenprojekte bei der Intomics A/S, Lyngby, Dänemark
  • Betreuung von Diplomarbeiten in der Bioinformatik und der Informatik sowie Studentenprojekte und Studienarbeiten an der Universität Tübingen und am Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie, Tübingen, Deutschland
  • Gruppenleiter der Bioinformatik bei der LifeBits AG, Tübingen, Deutschland
  • Gruppenleiter des Teams, welches Enterprise JavaBeans Tutorialbeispiele programmierte und Kunden zur Verfügung stellte; darüber hinaus verantwortlich für die Einarbeitung neuer Mitarbeiter bei der abaXX Technology GmbH, Stuttgart, Deutschland
  • Gruppenleiter des ?Querschnittsbereichs? bei der science + computing GmbH, Tübingen, Deutschland

Betriebssysteme

UNIX Systemadministration
z.B., Linux (Debian, Ubuntu, SUSE)
Mac OS X Systemadministration
Windows Systemadministration
Grundkenntnisse

Programmiersprachen

Python, FastAPIs (uvicorn), Django
TypeScript, JavaScipt (Node.js)
R, Bioconductor
Java
Enterprise JavaBeans, JavaServer Pages, JavaServer Faces
C#
C++, C
Perl
PHP
Shell-Programierung
Bourne Shell, Bash Shell
PowerShell-Programmierung
SQL
MySQL, PostgreSQL, T-SQL

Einsatzorte

Einsatzorte

München (+50km)
Deutschland
möglich

Projekte

Projekte

9 Monate
2025-03 - 2025-11

Durchführung biostatistischer Auswertungen

Consultant Bioinformatics / Lead Bionformatician
Consultant Bioinformatics / Lead Bionformatician
  • Durchführung biostatistischer Auswertungen in Python und R
  • Fokus auf multi-omics Datenauswertungen in den Genomen Human und Mouse
  • Defintion eines Qualitäts-Scoringsystems für verschiedene Datensätze (Genomics, Proteomics, Massenspektrometrie), um den Vergleich von Datensätzen, die in verschieden Laboratorien erstellt wurden, zu ermöglichen, Implementierung in Python
  • Auswertung von Metagomics-Daten (Human)
  • Entwicklung voll automatischer Auswertungpipelines in Python
  • Entwicklung von FastAPIs für verschiedene bioinformatischer Tools und KI-Workflows
Alchemy Bio (USA, remote)
8 Monate
2024-05 - 2024-12

Entwicklung einer Python-Applikation

MOLEQLAR Analytics GmbH, Deutschland
MOLEQLAR Analytics GmbH, Deutschland
  • Entwicklung einer Python-Applikation, um Probeninformationen mittels GET/POST APIs zu verbeiten, wobei JSON-Daten in eine extern gehostete SQL-Datenbank integriert wurden
  • Entwicklung eines statistischen Frameworks zur inkrementellen Verarbeitung von LC-MS (Flüssigkeitschromatographie ? Massenspektrometrie) unter Verwendung der DIA-(Data Independent Acquisition-)-Software DIA-NN. Automatisierung der gesamten Datenanalyse in Python
  • Verarbeitung von LC-MS-Datensätzen von Histonen mit der Software Skyline, Erkennung posttranslationaler Modifikationen (PTMs) sowie von differentiell exprimierten Histonen, beispielsweise mithilfe von Student-t-Tests und Wilcoxon-Rangsummentests in R
Senior Scientist Bioinformatics
2 Jahre 8 Monate
2021-08 - 2024-03

Entwicklung automatisierter LC-MS-(Flüssigkeitschromatographie-Massspectrometrie)-Pipelines

Senior Bioinformatician
Senior Bioinformatician
  • Aufbau und Leitung der bioinformatischen Guppe
  • Entwicklung automatisierter LC-MS-(Flüssigkeitschromatographie-Massspectrometrie)-Pipelines in Python und C#
  • Entwicklung von Algorithmen und automatisierten Arbeitsabläufen in Python für die Verarbeitung und Analyse von LC-MS-Daten
  • Vergleich verschiedener DIA-(Data Independent Acquisition)-Softwarelösungen und Entwicklung entsprechender Python-Programme, um mit den Softwärelösungen arbeiten zu können
  • Erstellung einer Django-Webanwendung mit einer PostgreSQL-Datenbankanbindung, um die Eingabe von LC-MS-Daten und die Suche nach solchen Einträgen den Experimentatoren zu ermöglichen
  • Etablierung von Versuchplanungen (Design of Expriments (DoEs)), Implementierung in Python
  • Entwicklung und Automatisierung von Pipelines zur Identifizierung von Peptid- und Protein-IDs mittels DDA (Data Dependent Acquisition)
  • Entwicklung und Implementierung von Algorithmen in Python, um die zugrunde liegenden biologischen und physikalischen Mechanismen der entsprechenden Massenspektrometrie-KITs zu entschlüsseln
  • Mitwirkung an zahlreichen Forschungsprojekten
  • Einrichtung und Wartung eines GitLab-Servers sowie Einführung von Git als Versionskontrollsystem
  • Betreuung einer Masterarbeit
PreOmics GmbH, Planegg, Deutschland
2 Jahre 11 Monate
2018-09 - 2021-07

Entwicklung und Implementierung eines Deep-Learning-Algorithmus

Senior Scientist Bioinformatics
Senior Scientist Bioinformatics
  • Gründung und Leitung des Bioinformatik-Expertenteams
  • Entwicklung und Implementierung eines Deep-Learning-Algorithmus (unter Verwendung der Bibliotheken Keras und TensorFlow) zur Vorhersage optimaler Stabilisierungsformulierungen für Arzneiwirkstoffe (z. B. Viren, Proteine, insbesondere Antikörper) in Flüssigkeiten und Gefriertrocknungen
  • Entwicklung einer SQL-Datenbank für Wirkstoffe und Arzneimittel mit einer Weboberfläche in C# (mit ASP.NET MVC als Framework und TypeScript als Frontend)
  • Entwicklung eines Algorithmus in Python zur Ableitung von Metamerkmalen (spezifischen relevanten Eigenschaften) von Proteinen aus den Analysedaten, die vom Vorhersagealgorithmus der stabilisierenden Formulierungen verwendet werden
  • Entwicklung und Erweiterung von Versuchsplänen (Design of Experiments [DoEs]), Implementierung in R
  • Mitwirkung an einem Förderantrag der Bayerischen Forschungsstiftung
  • Mitwirkung an der Planung eines Developability-Assessments-Projekts in Zusammenarbeit eines strategischen Partners der Leukocare AG
Leukocare AG, Planegg, Deutschland
9 Monate
2018-01 - 2018-09

Rückkehr von Dänemark mach Deutschland

  • Behördliche Formalitäten: Versicherungen in Dänemark kündigen und in Deutschland neue abschließen, dänischer Auslands TÜV, damit das Auto von Dänemark nach Deutschland asgeführt werden darf, Verkauf der Wohnung in Dänemark usw.
2 Jahre 3 Monate
2015-10 - 2017-12

Leitung und Mitwirkung an zahlreichen pharmazeutischen Projekten

Senior Bioinformatics Expert
Senior Bioinformatics Expert
  • Leitung und Mitwirkung an zahlreichen pharmazeutischen Projekten mit Schwerpunkt auf der Evaluierung von Biomarkern unter Einsatz von Microarrays, Next-Generation-Sequenzierungen, Signalweganalysen (WikiPathways und Reactome Pathway Database) sowie Analysen von Protein-Protein-Wechselwirkungen (Systembiologie). Entwicklung von Programmen in Python, Perl und R unter Verwendung von Bioconductor-Paketen und der Software Cytoscape
  • Auswertung von NGS-Datensätze (Next-Generation-Sequenzierungen) von Ion Torrent RNA-Seq (Human)
  • Entwicklung von Python-Programmen, um überlappende Protein-Protein-Netzwerke zusammenzuführen und Gene-Ontology-Informationen den Knoten dieser Netzwerke hinzuzufügen
  • Erstellung statistischer Modelle (linearer und nichtlinearer) zur Analyse von Metagenomics-Daten, Implementierung in R
Intomics A/S, Lyngby, Denmark
12 Jahre
2003-10 - 2015-09

Genomics- und Transcriptomics-Projekte

Wissenschaflicer Mitarbeiter in der Bioinformatik
Wissenschaflicer Mitarbeiter in der Bioinformatik
  • Mitwirkung an zahlreichen Genomics- und Transcriptomics-Projekten verschiedener Modellorganismen, darunter A. thaliana, P. reticulata (Guppy), D. melanogaster und C. elegans (Microarray- und Tiling-Array-Analysen, NGS-Analysen (Next-Generation-Sequenzierung))
  • Entwicklung von Programmen in Java, Perl, C++ und R in Verbindung mit Bioconductor-Paketen für statistische Analysen und zur Visualisierung analysierter Daten
  • Entwicklung und Implementierung einer Enterprise JavaBeans-Anwendung mit JavaServer Faces als Frame Framework und einer zugrunde liegenden MySQL-Datenbank-Anbindung, die es Forschern ermöglicht, Oligonukleotid- und Plasmidsequenzen samt deren Metainformationen einzugeben und nach diesen zu suche suchen (schließlich einer BLAST- Suche)
  • Implementierung einer PHP/Perl-Pipeline, um Rohdaten von Read-Sequenzen zu verarbeiten und diese automatisch zusammen mit den zugehörigen Metainformationen in ein lokal bereitgestelltes SRA (Short Read Archive) mit einer zugrunde liegenden MySQL-Datenbank einzutragen
  • Implementierung einer PHP-Pipeline mit der PHP-PEAR-Erweiterung, um EST-Sequenzen von P. reticulata (Guppy) in eine MySQL-Datenbank einzutragen und über eine Weboberfläche danach suchen zu können, bei Bedarf auch eine Blast-Suche
  • Mitwirkung an mehrern internationalen Veröffentlichungen
  • Halten von Vorlesungen in deutscher und englischer Sprache an der Eberhard Karls-Universität Tübingen (?Bioinformatik für Biologen?) und am Max-Planck-Institut (?PhD advanced course for next generation sequencing?)
  • Betreuung von Diplomarbeiten in der Bioinformatik und der Informatik
  • Betreuung mehrer Studentenprojekte und Studienarbeiten
Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie
1 Jahr 2 Monate
2002-08 - 2003-09

Phylogenien von Prokaryoten

Postdoc in der Bioinformatik / Gruppe Algorithmen in der Bioinformatik
Postdoc in der Bioinformatik / Gruppe Algorithmen in der Bioinformatik
  • Hauptsächlich auf dem Gebiet der Phylogenien von Prokaryoten gearbeitet, dazugehörige Programme in Java implementiert, was zu einem Vortrag der ECCB-Konferenz und einer Veröffentlichung in der Fachzeitschrift Bioinformatics führte
  • Betreuung einer Studienarbeit
Eberhard Karls-Universität / Wilhelm-Schickard-Institut, Tübingen, Deutschland
11 Monate
2001-09 - 2002-07

Entwicklung theoretischer Modelle

Gruppenleiter der Bioinformatik
Gruppenleiter der Bioinformatik

  • Aufbau und Leitung der Bioinformatik-Gruppe als Kompetenzzentrum
  • Entwicklung theoretischer Modelle zur Kinetik von oberflächengebundenen und diffusionsbegrenzten Bindungsvorgängen sowie deren Umsetzung in C++- und Java-Sourcode

LifeBits AG Tübingen, Deutschland
11 Monate
2000-10 - 2001-08

Entwicklung am Online ?Sheego Shop? in Enterprise JavaBeans

Java EJB Consultant im e-Commerce
Java EJB Consultant im e-Commerce
Intershop Communications GmbH, Stuttgart, Deutschland

Aus- und Weiterbildung

Aus- und Weiterbildung

1993 - 1997

Dr. rer. nat. (Doktorabeit in der Kurzzeitspektroskopie und Laser-Physik)

Benotung: ?cum laude?

Max-Born-Institut und Humboldt-Universität zu Berlin, Deutschland


1986 ? 1992

Diplomphysiker

Benotung: 2 (?gut?)

Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg, Germany

Kompetenzen

Kompetenzen

Top-Skills

Python Künstliche Intelligenz Statistik TypeScript JavaScript C# Java R Shell-Script PowerShell SQL Machine Learning Neural Network Versuchsplanung/Design of Experiment Unix-Administration Massenspektrometrie Transcriptomics/Genomics/differentially expression

Produkte / Standards / Erfahrungen / Methoden

Profil

Erfahrener Data Scientist mit fundierten Fachkenntnissen in der Softwareentwicklung und im Software-Engineering. Beherrscht eine Reihe von Programmiersprachen sowie Cloud Computing (zusammen mit Docker und Kubernetes) und künstliche Intelligenz-Workflows. War in verschiedenen Funktionen in Deutschland, Dänemark und den USA tätig, und dabei in erster Linie für die Bioinformatik verantwortlich. Ergebnisorientiert mit langjähriger Team- und Projektleitererfahrung. Ausgezeichnet durch klare Kommunikation, Unterstützung von Kollegen und Mitarbeitern sowie Soft Skills.


Besondere Fähigkeiten und Kenntnisse

IT-Kenntnisse

  • Versionskontrolle: Git (GitHub, GitLab, selbst gehostetes GitLab), SVN, CVS
  • Entwicklung-Tools: Eclipse, Visual Studio, Visual Studio Code, PyCharm, Posit/Rstudio


Cloud Computing & DevOps

Methoden & Platform: Scrum, Conda/Anaconda, Cloud Computing (AWS), Docker, Kubernetes


Maschinelles Lernen & Künstliche Intelligenz

  • Maschinelle Lernen: Deep Learning Algorithmen/Neuronale Netwerke, Random Forests, XGBoost, Entscheidungsbäume
  • KI Agenten
  • Statistische Modellierung
  • Versuchsplanung (Design of Experiments (DoEs))


Führung

  • Aufbau und Gruppenleiter der Bioinformatik bei der PreOmics GmbH, Martinsried, Deutschland 
  • Aufbau und Gruppenleiter des Bioinformatik-Expertenteams bei der Leukocare AG, Martinsried, Deutschland
  • Projekleiter für Kundenprojekte bei der Intomics A/S, Lyngby, Dänemark
  • Betreuung von Diplomarbeiten in der Bioinformatik und der Informatik sowie Studentenprojekte und Studienarbeiten an der Universität Tübingen und am Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie, Tübingen, Deutschland
  • Gruppenleiter der Bioinformatik bei der LifeBits AG, Tübingen, Deutschland
  • Gruppenleiter des Teams, welches Enterprise JavaBeans Tutorialbeispiele programmierte und Kunden zur Verfügung stellte; darüber hinaus verantwortlich für die Einarbeitung neuer Mitarbeiter bei der abaXX Technology GmbH, Stuttgart, Deutschland
  • Gruppenleiter des ?Querschnittsbereichs? bei der science + computing GmbH, Tübingen, Deutschland

Betriebssysteme

UNIX Systemadministration
z.B., Linux (Debian, Ubuntu, SUSE)
Mac OS X Systemadministration
Windows Systemadministration
Grundkenntnisse

Programmiersprachen

Python, FastAPIs (uvicorn), Django
TypeScript, JavaScipt (Node.js)
R, Bioconductor
Java
Enterprise JavaBeans, JavaServer Pages, JavaServer Faces
C#
C++, C
Perl
PHP
Shell-Programierung
Bourne Shell, Bash Shell
PowerShell-Programmierung
SQL
MySQL, PostgreSQL, T-SQL

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